在此阶段可采用以下的方法
（1）限制
针对某一或某些可能的混杂因素，在设计时对研究对象的人选条件予以限制。对研究对象针对潜在的混杂因素实行限制后，可得到同质的研究对象，从而可防止某些混杂偏倚，有利于对研究因素与疾病之间的关系作出较为准确的估计。但是在这种情况下，研究对象对总体的代表性可能会受到影响，因而研究结论的外推性会受到一定限制。
（2）匹配
匹配是指在为指示研究对象选择对照时，使其针对一个或多个潜在的混杂因素与指示研究对象相同或接近，从而消除混杂因素对研究结果的影响。匹配在非实验性和实验性研究设计中均可应用。
（3）随机化
随机化指以随机化原则使研究对象以等同的几率被分配在各处理组中，从而使潜在的混杂因素在各组间分布均衡。随机化方法常用于实验性研究，以在临床试验中最常用。
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